Od drugiego rozbioru Polski w 1793 r. do końca stycznia 1945 r. Skwierzyna nazywała się Schwerin an der Warthe. W okresie międzywojennym administracyjnie należała m.in. do Marchii Granicznej Poznań-Prusy Wschodnie, rozwiązanej w 1938 r. Niekiedy była mylona ze znacznie większym miastem Schwerin w Meklemburgii.
Pod koniec drugiej wojny spora część zabudowań została zniszczona przez radzieckich żołnierzy. Spalono m.in. wiele kamienic w obrębie rynku. Dlatego obecnie miasto wygląda zupełnie inaczej, niż 70 lat temu. I trzeba oddać, że wiele straciło ze swojego dawnego uroku.